免疫学科现为浙江省重点学科，博士学位授予点。新浙江大学成立后，在陈宜张院士的倡议下，在校、院领导的直接关心和支持下，2000年以原免疫学教研室为基础组建了浙江大学免疫学研究所，将“国内领先、国际一流”作为学科建设目标，近几年本学科在科学研究、人才培养、实验室建设等方面都取得了飞速的发展。目前本学科拥有一支以中国工程院院士曹雪涛教授为学科带头人，老中青相结合并以年青人为主体的科技攻关队伍。目前免疫学科系共有教职工13名，其中教授8名（含兼职1名），副教授4名，讲师1名。其中中国工程院院士1名（兼），国家杰出青年基金获得者1名，国家优秀青年基金获得者3名，国家“973”计划首席科学家1名，入选万人计划1名，科技部中青年科技创新领军人才2名，教育部新世纪人才获得者3名，求是特聘教授2名。

经过几年的积累和发展，在学科建设方面已形成了优势和特色，具有处于领域前沿的研究方向，即围绕下列几个方面开展创新性研究：免疫识别和免疫调控的分子机制；树突状细胞的分化发育、功能调控及其新功能的研究；T淋巴细胞分化发育机制研究；免疫新分子的克隆和功能研究。以第一和通讯作者单位在SCI收录的国际期刊发表论文120余篇，尤其是在Cell（2篇，2013年和2017年），Nat Immunol，Immunity，J Exp Med，Gut，Nat Comm等期刊连续发表了创新性成果。曹雪涛教授课题组发现了Siglec-G介导的RNA病毒逃逸机体天然免疫的新型分子机制，2013年发表于顶级期刊Cell，并入选“浙江大学十大学术进展”。鲁林荣教授课题组发现了一个调控T细胞发育的关键分子Tespa1并揭示了其功能，2012年度发表于Nature子刊Nat Immunol。

免疫学科系承担了五年制/七年制/八年制临床医学、留学生、生物医学专业、研究生等各个层次的教学任务（涵盖免疫学、分子医学、发育生物学）。教学质量优良，近三年有2位教师获浙江大学优质教学奖，1位教师获医学院优秀教师和留学生教学优秀教师，1位教师获浙江大学青年教师教学竞赛三等奖，4位教师获医学院研究生教学优秀指导教师。免疫学课程组获2014年度医学院优秀课程组。学科教师作为负责人主持教改项目5项，参编了人民卫生出版社、人民军医出版社等出版的多部免疫学教材。指导本科生参加2014年度全国大学生“基础医学创新论坛暨实验设计大赛”，获得二等奖2项，以及2015年度学校“挑战杯”二等奖1项。培养硕士、博士100余人，博士后10余人。多位研究生的成果发表于Immunity，Nat Comm，J Immunol等主流期刊，并获得国家奖学金资助。